Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DffbO54788 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DffbO54788 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DffbO54788 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DffbO54788 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffbO54788 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffbO54788 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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