Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 230.9 ms