Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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FxnO35943 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FxnO35943 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FxnO35943 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FxnO35943 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FxnO35943 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FxnO35943 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FxnO35943 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FxnO35943 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FxnO35943 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FxnO35943 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FxnO35943 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FxnO35943 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FxnO35943 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FxnO35943 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FxnO35943 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FxnO35943 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FxnO35943 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FxnO35943 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FxnO35943 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FxnO35943 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FxnO35943 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FxnO35943 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FxnO35943 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FxnO35943 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FxnO35943 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FxnO35943 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FxnO35943 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FxnO35943 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FxnO35943 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FxnO35943 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FxnO35943 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FxnO35943 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FxnO35943 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FxnO35943 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FxnO35943 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FxnO35943 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FxnO35943 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FxnO35943 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FxnO35943 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FxnO35943 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FxnO35943 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FxnO35943 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FxnO35943 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FxnO35943 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FxnO35943 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FxnO35943 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FxnO35943 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FxnO35943 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FxnO35943 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FxnO35943 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FxnO35943 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FxnO35943 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FxnO35943 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FxnO35943 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FxnO35943 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FxnO35943 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FxnO35943 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FxnO35943 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FxnO35943 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FxnO35943 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FxnO35943 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FxnO35943 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms