Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gp1baO35930 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms