Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk3O35492 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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