Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atf6bO35451 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms