Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf5O35326 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms