Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Bhlhe40O35185 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms