Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad6O35182 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad6O35182 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad6O35182 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad6O35182 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad6O35182 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad6O35182 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad6O35182 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad6O35182 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad6O35182 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms