Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcns1O35173 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms