Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1aO35134 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.8 ms