Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms