Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms