Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Smim22J3QP37 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Smim22J3QP37 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Smim22J3QP37 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Smim22J3QP37 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms