Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top6blJ3QMY9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Top6blJ3QMY9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Top6blJ3QMY9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top6blJ3QMY9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Top6blJ3QMY9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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