Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm3336J3QMQ6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm3336J3QMQ6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm3336J3QMQ6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3336J3QMQ6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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