Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21411J3KMS0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms