Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nccrp1G3X9C2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms