Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ccl26F8VQM2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl26F8VQM2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl26F8VQM2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl26F8VQM2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl26F8VQM2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl26F8VQM2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ccl26F8VQM2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ccl26F8VQM2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ccl26F8VQM2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl26F8VQM2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl26F8VQM2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl26F8VQM2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ccl26F8VQM2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ccl26F8VQM2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ccl26F8VQM2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ccl26F8VQM2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ccl26F8VQM2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ccl26F8VQM2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl26F8VQM2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl26F8VQM2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl26F8VQM2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ccl26F8VQM2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ccl26F8VQM2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ccl26F8VQM2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ccl26F8VQM2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ccl26F8VQM2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl26F8VQM2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms