Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc6F8VPZ5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms