Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer4aF8VPX6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms