Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5160F8VPN3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5160F8VPN3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms