Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Crocc2F6XLV1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Crocc2F6XLV1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms