Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb2E9Q7L1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms