Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tarbp1E9Q368 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms