Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20425E9Q035 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms