Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde2E9PUP1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde2E9PUP1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms