Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms