Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms