Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3543D3Z235 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3543D3Z235 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3543D3Z235 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3543D3Z235 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3543D3Z235 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3543D3Z235 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3543D3Z235 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3543D3Z235 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3543D3Z235 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3543D3Z235 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3543D3Z235 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3543D3Z235 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3543D3Z235 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3543D3Z235 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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