Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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