Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms