Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Abcc8B2RUS7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms