Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms