Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NhsB1AV60 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NhsB1AV60 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms