Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Trabd2bB1ATG9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trabd2bB1ATG9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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