Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms