Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap221A9Q751 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms