Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rtf1A2AQ19 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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