Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabreA2AMW3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms