Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms