Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms