Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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PtprfA2A8L5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprfA2A8L5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprfA2A8L5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprfA2A8L5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprfA2A8L5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprfA2A8L5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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