Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms