Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms