Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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