Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3550W4VSN7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms