Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer1Q9Z2Y3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms