Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gria3Q9Z2W9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms