Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac5Q9Z2V6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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